imaris 9发行说明

欢迎来到Imaris 9.0发行说明。请看看overview of Imaris Release notes有关先前发布的功能和固定错误的信息。

版本日期：2017年7月18日

能够“大规模模型渲染”的表面

使用Imaris9，可以交互地呈现100GB尺寸或更大的表面。与Imaris的经过验证的体积渲染技术完全正如Imaris的那样，这种新的表面渲染技术基于多分辨率的Octree。以下渲染显示具有不同分辨率级别的块的表面。

利用这种技术，Imaris9可以以数十亿三角形的交互式巨大的表面渲染。

实现大型表面快速渲染的技术基于以下功能

• 3D块明智的布局中的多分辨率曲面
• Renderer loads optimal surface resolution levels to match screen resolution
• vram和RAM中的数据缓存
• 渲染，减压和装载的多线程

Fast Surfaces Computation

从大图像有效地计算表面伊玛里斯9 runs blockwise and multithreaded computation of surfaces. The computation uses system resources efficiently. The computation of surfaces from a 100GB image will still take hours to complete but a) it is possible and b) the computation is faster than in previous imaris versions despite the fact that in Imaris9 surfaces need to be computed at many resolution levels to facilitate fast rendering.

Surfaces Performance

性能测试表明，Imaris9计算表面几乎比imaris8.1.1速度快。

Surfaces Render Option “Slicer”

In Imaris9 surfaces can be rendered on a slicer (ortho or oblique). This is a valuable tool to compare the segmentation to the original data.

2D图像的曲面在切片视图中自动呈现

imaris9是本身呈现2D曲面作为2D的第一个iMaris版本。（以前版本的iMaris计算了来自2D图像的3D表面。）

混合模式传递函数

在Imaris9中，在卷组件的“设置”选项卡上的用户界面中调整混合渲染的传递函数。传递函数通过将强度映射到不透明度来确定体素的不透明度（透明度）。传递函数被显示为覆盖到频道强度的直方图上的图表。垂直轴描绘了不透明度值。图表顶部的值完全不透明。底部的值是完全透明的。

可以通过拖动传输函数编辑器中的控制点或者通过数字输入字段来更改传递函数，以便在不同文件中进行比较时更准确的定位。单击行允许向右移动传输函数。

更改显示调整变化颜色

更改传递函数更改呈现的内容

传输函数存储在IMS中

传输函数设置与显示最小/最大单独存储在IMS文件中。

混合模式自动设置改进

imaris9有一个改进的自动调整功能，可在混合模式下的卷设置选项卡上提供。改进是两倍。新功能更快，它会产生更好的结果。

常规阴影模式自动显示调整改进

Imaris9具有自动调整功能，可在常规阴影模式下在“卷设置”选项卡上提供。

Ctrl +右键单击显示调整中的颜色栏执行“自动”在一个通道上执行“自动”

因为“自动调整所有通道”按钮调整所有通道，有时使用此快捷方式仅用于自动调整单个通道。

Fast Save of Changes to Display Adjustments

当用户打开图像并更改显示调整时，然后决定保存那些更改的旧版本iMaris花了很长时间才能保存更改。在imaris9中，这是几秒钟。

直方图放大

直方图在顶部有一个变焦条。鼠标滚轮允许放大和缩小。右键单击缩放栏允许平移。双重单击重置缩放。

谱系树图形导出

谱系树可以作为SVG向量图形或作为高分辨率TIF图像导出，以便于在其他软件中导入以准备出版质量图形。

快照到预定义大小

The user can specify a snapshot output width and height in snapshot preferences.

为了获得一个很好的预览，他/她可以从快照下拉中选择，以“固定大小”渲染窗口，然后在视口中导致与快照的宽度/高度相同的宽高比，以便他/她很容易预览结果（在屏幕分辨率）

H264 Video Codec

将使用H264压缩编解码器保存为MP4保存为MP4的imaris9视频。或者，它们可以保存为RAW或TIFF系列（所有其他选项被删除以简化UI）。

Automatic Settings/Preferences Migration

System preferences are automatically migrated during installation of Imaris. User preferences are automatically migrated on first start of Imaris.

新文件读者

• aperio svs.
• 哈姆松NDPI.

文件阅读器插件功能

Imaris9搜索具有FILEREADER API的DLL的FILEREADER插件目录。当发现这样的DLL时，它将被添加为Imaris的FILEREADER。

The API supports both readers that read (contain) just one resolution level as well as readers that allow to read multiple resolution levels. In the latter case it is possible that Imaris renders files opened through a reader plugin in native mode (without reading the entire file before rendering).

修复了错误

Bugs fixed in 9.0
5038.	COLOC ROI直方图在更改频道选择后不会更新
5318.	Mask generates corrupt channel with horizontal stripes
7147.	Problems with .mov and .mp4 movie types with less than 6fps
7652	从Czi文件中未读取的波长
8658	表面渲染失败在巨大的XY图像上
8703	在较大的时间序列连续接受几次快照后崩溃
9066	site.cfg文件已损坏
9354	通过“添加时间点”添加多个LIF文件获取时间戳错误
9411.	删除中等大小的数据集上的切片会导致崩溃
9439.	Context Help for Drift Correction Dialog not working
9501	用轮廓删除曲面时崩溃
9663	Relative size of scale bar font not maintained when scale factor is used
9678	一些斑点的斑点“voxel count”统计数据为零
9749.	Hard to determine which license is selected in Administrator
9762	在添加一些手动丝石后，崩溃尝试从竞技场开立第二数据集
9771	Using context help in some creation wizards fails because of non-existing paths
9788	imaris无法从FV3000共焦点读取.oir文件的时间点
9794	Zeiss .LSM文件在8.3.1中正确读取，不正确地加载8.4.0
9797	“最大重叠”跟踪算法的描述缺少
9798	显示“跟踪单元”一步的帮助链接
9800	Reference Manual states that the Lineage algorithm supports merges
9815	最小的窗口尺寸太大了
9816	在现场中使用颜色编码对象移动参考帧会导致重新计算渲染区域的每个鼠标上的统计信息
9819	Aberrant (straight line) path generated by semi-automatic AutoPath
9820	来自Fiji的图像在Imaris 8.4中禁用“另存为...”
9830	Incorrect visualization of channel intensities in specific file
9846	CZI文件中的错误时间间隔
9851	表面创建失败，特定的2D数据集，具有21,400,000个三角形
9852	3D视图参考帧设置的上下文敏感帮助链接不会解释选项卡
9853	注释未放置在光标位置
9855	在“帮助”菜单下，需要在“键盘和鼠标”选项中记录新的灯丝键盘快捷键
9856.	完成创建向导时崩溃，如果只选择了多个ROI中的一个
9865	在最近的文件列表中的文件的网络驱动器中启动时崩溃
9870.	大型批量集合的“导出统计信息”选项需要很长时间才能导出。
9873	距离变换频道的显示失败了超过其他模式
9887.	XT Filament Spine classify has unhindering error message when launched from the .m file
9895.	Export of file with manually created tracks causes statistics to re-calculate for a number of hours
9896	扭曲的LILED LSM文件扭曲
9899	在Imaris 8.3和8.4中，在Imaris 8.3和8.4中读取Multi系列TIFF
9904	iMaris XT描述在线MATLAB接口API中的跟踪曲面不对
9912	Uninstall of Imaris 8.4.x removes IsServerInstalled from the registry
9923	单元格跟踪的参考页太大
9930.	Imaris 8.4中手动灯丝示踪器中的滑块与光标无关
9931	伊玛里斯crash when clicking "File name with Delimiter" in TIFF reader settings
9933	折锯器撤消从所有时间点移动到第一个位置
9945	表面距离变换后的条纹伪影
9949	使用商店时不保存某些卷设置
9952	正确的灯丝AutoPath中的正确快捷方式描述参考手册
9958	Rounding issue with Time bar display
9974	在时间间隔中闪烁大3D卷的亮度
9984	时间绘制的时间错误（出口），但是为出口所有统计数据或在VANTAGE中正确
9986	伊玛里斯is not able to read the z voxel size of Olympus .oir file generated from FV3000
10001	批量单元格将数据导出到IMS时丢失
10002	ND2游戏中时光倒流是一个单一的时间点
10020.	显示帮助不适用于竞技场商店对话
10022.	Image of Arena in Preface has bad color resolution
10032.	撤消，重做然后再次撤消不再起作用
10034	细丝 - 编辑Tab - Diameter在手册中的实体描述
10038.	Dataset imported does not get correct Display Adjustment Min/Max settings
10040.	当IMS更改为LUT时，映射颜色不会保存在关键帧动画中重新加载
10048.	在参考手册中未提及WRL支持
10061	在竞技场中的图像加载导致“未找到挂载点”错误消息
10071.	跟踪速度最小和最大值与轨道速度均值不一致
10075.	重新采样以对准参考框架的图像不会在8.4中进行旋转漂移
10126	具体文件不能使用1D Vantage图
10129.	切换时间点时不会更新COLOC直方图
10162.	更改COLOC ROI阈值可能导致崩溃
10192.	更新批量中位强度统计信息的参考手册
10200	当体素大小大于1时，框架盒子闪烁闪烁
10208	Mac Arena can't access files on a server requiring domain credentials

Imaris 9.0.1.

修复了14个错误（自Imaris 9.0.0以来）
10245	动画“框架”文本框在输入单个字符后丢失焦点
10251.	一些曲面的文档缺少XT接口方法
10262	在关键帧动画中显示未正确插值的显示
10269	Large jumps along the timebar during Surfaces preview can lead to the preview panel to disappear
10271.	曲面和细丝统计文档需要更新和修复
10286.	Slow Volume rendering in Imaris 9.0.0
10291.	Python xtension xtsurfacessplit未更新缺失曲面函数
10293	表面模型内存使用在检测期间比以前的版本更大
10298	Turning off Smoothing in new Surfaces creates huge amount of cache files
10302	在imaris9中保存统计数据不记得上次保存的文件夹位置，每次都会更改一次
10312	导出iMaris 9 Surface Creation参数使用不正确（灰色）图标重新导入
10322	Dragonfly许可证（以及推定的imaris核心许可证）具有灰色和/或灰度灰色的编辑/绘制/彩色选项卡
10327	一些.tif图像与imaris 9不再正确读取
10328	切割表面20-30切割导致切割工具中的一致不稳定性，并导致伊玛丽斯9崩溃