牛津仪器集团的一部分狗万正网地址
扩大

伊万里瓷器跟踪

Imaris为跟踪提供交互式处理,可视化和分析软件的3D和4D显微图像。Imaris for tracking具有最先进的体积渲染,加上对象检测和跟踪工具,是完美的研究人员谁想要自动分析移动对象,包括那些随着时间的推移而分裂的,创建一个谱系树图,并从他们的图像数据生成定量信息。它现在包含了在Imaris 9中引入的突破性技术,以解决当今图像分析的主要瓶颈——在数百gb的数据集中有效量化和表面可视化对象。

请求定价/免费试用 现有客户-卫星许可证

目标检测与跟踪运动的真实条件

Imaris for Tracking提供了经过验证的Imaris 3D跟踪算法的选择:Brownian Motion, autoregression Motion (Expert), Connected Components或Lineage,为不同类型的移动对象生成最准确的跟踪结果。用户可以在新的徒手坐标系统(参考系)内自动校正平移和旋转漂移或轨迹,或使用自动漂移校正选项。

运动

  • 使用提供的算法之一自动跟踪感兴趣的对象
  • 处理数以千计的对象和时间点
  • 使用多个可视化选项表示轨迹或位移
  • 计算平均和瞬时速度,加速度
  • 手动创建和编辑轨道

追踪细胞分裂和谱系

  • 使用提供的谱系算法设计跟踪分裂细胞和细胞核
  • 探索从一个祖细胞到最后一代的细胞命运
  • 自动创建可编辑的沿袭树
  • 标记选择的血统树分支与彩色标签和分析您的数据每个血统
  • 计算Cell Cycle Duration, Generation, Time Since First Division, Time Since Previous Division

参考系

细胞质,细胞核,核仁和各种小泡的群体可以检测和分析一个完整的细胞对象。

  • 建立一个新的坐标系统,可以用于标准化样品之间的测量,而不管他们的初始方向。
  • 可在数据集框架内自由移动和旋转;可见和固定飞机可用
  • 在移动或旋转的物体上设置一个参照系来分析内部较小物体的运动,即。旋转胚胎内的细胞,移动细胞内的囊泡,卵腔内的边缘细胞
  • 在参考帧模式下播放延时序列以使回放与之对齐
  • 在标准坐标系和参照系坐标系中进行统计

统计和测量

在分割图像数据后,Imaris计算了所有检测到的物体、表面和斑点的大范围统计数据。所有值都可以用于颜色编码,在Imaris中绘制(使用Vantage绘图)或导出。csv或。xls文件格式。下面列出的参数是生物学家最常用的统计类型。Imaris报道更多。

运动分析
  • 平均速度
  • 瞬时速度
  • 加速度
  • 轨道长度
  • 细胞周期时间
表面
  • 区域
  • 体积
  • 强度
  • Elipticity
  • 球形
  • 位置(x, y, z)
  • 强度
  • 号(计数)
  • 参照系距离
细胞周期
  • 细胞周期时间
  • 细胞周期位移
  • 一代
  • 从第一和上一组开始

跟踪编辑器和标签

Imaris for Tracking可以轻松手动编辑自动跟踪的结果。使用标签添加其他描述性参数。

跟踪编辑器

  • 连接或断开对象,以修改自动跟踪结果
  • 手动连接检测到的对象,并创建新的轨道,细胞分裂或融合
  • 排序跟踪或重组谱系树分支
  • 添加缺失的物体并将它们连接到轨道上
  • 通过任意选择的统计参数,同时为轨道和物体着色
  • 将跟踪结果导出为。tif或。svg

标签

  • 添加用颜色描述物体或物体组的独特特征的标签:来自同一母细胞的细胞,彼此接近的细胞,具有相似速度的细胞
  • 颜色斑点和表面根据分配的标签,更好地可视化之间的对象关系
  • 可视化对象与选定的标签
  • 当统计参数导出时——标签作为额外的描述参数,并允许在选定的组中进行进一步的分析。

可视化和动画导出

Imaris for Tracking提供了一套完整的功能,用于可视化多通道显微镜数据集,从静态2D图像到3D时间序列,无论其大小和格式,以及多种图像和视频导出选项,以增强您的论文和演示。

额外的资源

伊万里瓷器学习中心主办了广泛的教程视频,如何到文章和网络研讨会,以指导您通过许多功能的Imaris。我们在下面提供了一些链接,让你开始了解我们的一些最新发展。