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扩张

Imaris Essentials

Imaris Essentials软件包是一种交互式可视化和分析软件,用于3D和延时显微镜图像,带有用于大数据集的高级解决方案(Terabyte范围) - 基于我们的多分辨率技术的智能音量和表面渲染,以及无限制图像的表面计算尺寸。Imaris Essentials软件包非常适合需要易于使用的软件制作惊人快照和动画,从其显微镜数据中生成定量信息,对象距离和重叠测量,共同定位研究,绘图和统计分析。Imaris Essentials软件包包括易于使用机器学习对象分类器和标签。

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3D可视化和显微镜渲染

Imaris Essentials提供了一组完整的功能,用于可视化多通道显微镜数据集,从静态2D图像到3D时间序列,无论其大小和格式如何。使用用户可以使用Imaris Essentials:

  • 组织和管理完整的实验,包括图像和数据分析
  • 使用Premier 3D/4D卷渲染模式:( MIP,混合,阴影投影,正常阴影)
  • 受益于Imaris的高性能IMS文件格式,该格式即使在非常大的数据集中也可以保证平稳导航
  • 结合音量渲染,对象表示,剪裁平面和2D切片机
  • 轻松制作高质量的动画和高分辨率快照,准备演示和出版物

定量显微镜图像分析 - 对象检测

Imaris For Essentials提供了多种选项,可以通过分步向导检测和建模与生物学相关的结构,并在工作流程中每个点的结果预览。

表面

使用Imaris 3D表面精确可视化和测量样品中各种物体的形状,例如细胞器,核,生物膜,细胞,组织,器官,胚胎,组织以及整个生物体。

  • 数据集中指定区域的表示区域的表示
  • 根据全球或本地阈值或基于用户定义的兴趣区域创建的计算
  • 可以计算和可视化数据设置为tobytes的数据
  • 充当可以计算所有所需统计数据的容器

斑点

使用Imaris斑点来检测:颗粒,蛋白质簇,囊泡,核仁,核,中心体,细胞和细菌。

  • 数据中的模型点状或类似囊泡的结构。
  • 可以在具有10秒或100个对象的图像中识别。
  • 计算每个对象的XYZ坐标,可以测量与其他对象的相对距离
  • 可以在时间上跟踪(5个高性能运动算法)

机器学习对象分类

基于选定的统计量或2个特征的组合,具有可训练的机器学习分类器(ML)的检测对象(细胞,核,vescicle)的自动分类。类标有类别,可用于视觉呈现,绘图和下游分析(统计的导出)。

  • 可训练的机器学习分类器
  • 基于其本地环境或内在特征的对象分类
  • 标签 - 分类对象标记(颜色和名称),该对象在统计信息中导出
  • 比较标签课的可能性

距离测量,空间相互作用和共定位

Imaris Essentials提供了多种方法,可以根据生物结构在3D空间中的分布进行研究。Imaris Essentials包括COLOC - 最强大的共定位分析工具,用于量化和记录多个染色生物学成分的共同分布。

  • 皮尔逊的系数,曼德的系数,共定位的体素,共定位的百分比,在感兴趣区域(ROI)内计算出来
  • 到最近的斑点或表面的最短距离
  • 统计计算是否吸引到感兴趣的表面
  • 表面之间的体积重叠

绘制工具和数据挖掘

Imaris Essentials包括一个无缝集成的工具,可以探索实验组之间的差异(例如,对照与测试) - Imarisvantage。它允许创建交互式图,以帮助说明对象测量或对象组之间的关系/模式/差异并揭示隐藏的关系。

  • 二维散点图
  • 空间分布图提到对象周围的随机分布
  • 单维框图用于小组比较
  • 小组比较:t检验,F检验,Wilcoxon测试,Kolmogorov-Smirnov测试
  • 交互的对象库
  • 交互的多维对象散点图

其他资源

Imaris学习中心主持各种教程视频,操作方法和网络研讨会,以指导您完成Imaris的许多功能。我们在下面提供了一些链接,这些链接将使您开始使用一些最新的发展。您也可以查看哪些新功能最新版本的Imaris