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扩张

定量具有空间分析的细胞微环境

多重成像的快速发展领域揭示了越来越复杂的细胞定位和细胞 - 细胞相互作用与细胞和组织级生理学中的重要作用。

在这个网络研讨会上,华盛顿大学助理教授Michael Gerner博士,华盛顿大学博士学者博士·斯托尔斯科斯博士,将描述一种能够利用这些信息丰富的数据集的空间分析工具箱:Hiso-Cytometric多维数据集分析管道(Cytomap)。Cytomap包含多种用于数据聚类,位置相关,维度降低和2D / 3D区域重建的多种方法,以揭示细胞异质性的特征,量化这些细胞跨组织的这些细胞的图案化,并确定组织组织的大规模原理。

在网络研讨会的前半部分,Gerner和Stolzfus将介绍Cytomap中可用的工具,用于高尺寸图像分析,并证明细胞瘤图的效用在研究淋巴结淋巴结中的表型复杂免疫细胞亚群的微肿瘤,用复杂的蜂窝空间图案化。在网络研讨会的下半部分,Gerner和Stolzfus将出现分析工作流程的实时演示,显示如何使用Cytomap如何了解组织结构并在空间分辨的数据集中揭示组织组织的特征。

主要学习目标:

  • 了解Cytomap中可用的各种空间分析工具
  • 了解数据预处理步骤:蜂窝特征,表面对象和数据格式
  • 了解Cytomap中的工具,用于量化细胞异质性和定位
  • 了解如何使用Cytomap执行高级空间统计:地区和组织组织

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