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OPenT项目由Gabriel Martins博士和OPT数据分析与Imaris|网络研讨会

WHEN SIZE MATTERS -网络研讨会

演讲者:Gabriel G. Martins博士和Dieter Göhlmann

发育生物学的一个长期挑战是研究体内和整个胚胎内的形态发生过程。传统的显微镜依赖于较薄的组织,通常是1到几个细胞层,或者使用2p共聚焦显微镜对较大的组织进行三维成像,通常是活体组织。

然而,没有一种技术能够对大多数中晚期脊椎动物胚胎进行深入观察。最近有两种技术帮助对固定的和活的厚标本进行成像:光学层析成像(又名OPT)和光片显微镜(Sharpe J et al. 2002)。科学296年,541 - 545;Huisken J et al . 2004。科学305:1007 - 1009)。

然而,商业解决方案要么是稀缺的,要么是不存在的(对于OPT来说),而且很少有原型系统可用。里斯本Oeiras高级成像单元设施负责人Gabriel G. Martins博士将提出一种完全开源、低成本的光学断层成像解决方案,称为OPenT,并展示从大胚胎获得的3D解剖数据集。

该系统的实现只需要一些基础的光学和电子学知识,使用OpenSPIN显微镜平台(Gualda E et al 2013;自然方法10:509-510)。他还将为发育生物学家提供一个在线解剖数据库资源,该资源正在用开源解决方案准备,目前被称为“Haeckaliens”。

主要学习目标:

  • 光学投影断层成像(OPenT)作为一种非破坏性的3D技术,使小物种的成像具有精确的解剖细节。
  • Imaris软件为OPenT图像提供强大的可视化和分析工具。

类别:网络研讨会

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