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3D/4D大数据可视化与分析

在Imaris中,您可以在几秒钟内查看并与大型数据集交互。只需下载FileConverter,将现有数据集转换为IMS,并使用Imaris 9的免费试用

  • 免费的IMS FileConverter for Windows和MacOS
  • Imaris IMS格式对于大型3D/4D数据集非常有效
  • 显示全分辨率3D IMS时间序列的最小加载时间
  • 极快的关键帧动画和高分辨率的快照
  • 在巨大的图像上计算和渲染多分辨率3D表面模型
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伊万里瓷器文件转换器

ImarisFileConverter的重新设计的GUI和批处理转换有效地转换多个大型数据集,以节省您的时间。然后可以在Imaris中非常快速地打开生成的ims文件。

  • 转换是多线程的(由用户选择的内核数量)。
  • 文件被丢弃到转换队列中,只需单击即可处理。
  • 在转换过程中可以添加其他文件。
  • 同时显示“读进度”和“写进度”。
  • 增加内存分配以处理大数据。
  • 每个转换都作为一个单独的进程运行。
获取文件转换器(Windows) 获取文件转换器(Mac)
Imaris中IMS文件的打开时间

快速tb可视化技术

tb大小的图像的快速可视化就是快速地将当前视图可视化所必需的数据加载到图形硬件中,并尽可能少地加载多余的数据。IMS文件格式和可视化管道通过以下特性实现了这一点:

  • IMS文件格式使用HDF5在3D分块布局中存储多分辨率图像金字塔。
  • 渲染器加载最佳图像分辨率级别以匹配屏幕分辨率。
  • GPU和RAM上的数据缓存显著提高了性能。
  • 数据采用无损压缩格式存储,节省存储空间。
  • 多线程的渲染和数据解压缩和上传方便了交互。

Imaris 9在文件阅读器插件目录中搜索具有FileReader API的dll。如果文件格式包含多个分辨率级别,Imaris将以本机模式快速呈现这些文件。

表面呈现

Imaris 9中的新表面渲染技术采用了Imaris经过验证的基于多分辨率八树的体渲染技术。现在可以可视化数百g大小的曲面了。有了这项技术,Imaris 9可以交互渲染由数十亿个三角形组成的大量曲面。

Imaris 9快速渲染大型曲面的技术基于以下特性:

  • 多分辨率表面在3D块布局
  • 渲染器加载最佳表面分辨率级别以匹配屏幕分辨率
  • VRAM和RAM中的数据缓存
  • 多线程的渲染,解压和加载

表面快速计算

Imaris 9以块和多线程的方式计算表面,以有效地分析大型图像(数百gb)。多亏了这项突破性的新技术,大图像的计算将成为可能,并且将比以前的Imaris版本要快得多。我们的表面计算时间的测试图像如下所示是Wasp_embryo的倍数。ims是通过使用Imaris中的“添加切片”创建的。系统规格:Win 7.1, 192GB RAM (Imaris内部内存限制为64GB), CPU Intel Xeon E5-2687 (x2),显卡Nvidia Quadro k5000,从HDD读取数据,缓存设置为SSD。

用于大型图像的丝状跟踪工具

随着我们的专利Torch™工具的推出,Filament Tracer中的Autopath和Autodepth跟踪方法都得到了显著改进,可以有效地在大型3D图像和密集网络中跟踪神经元。

跟踪与火炬™

这种专利解决方案带来了一种新颖的体可视化跟踪方法,比以往任何时候都更快、更有效。

  • 突出显示与跟踪光标非常接近的结构。
  • 使背景变暗以提高能见度
  • 便于在密集的神经网络中进行跟踪。
  • 在自动路径和自动深度跟踪方法中可用

跟踪与Autopath

新的功能已添加到Autopath跟踪方法,以优化大型3D图像,大大提高了速度和效率。

  • 在选择一个起点后,可以立即开始跟踪。
  • 跟踪可以很容易地从同一点暂停和重新启动。
  • 示踪过程中自动计算灯丝直径。
  • 深度可见性允许选择感兴趣的动态区域进行跟踪。
  • Autopath可以在初始视图外沿着细丝连续绘制

跟踪与Autodepth

自动深度现在使得绘制灯丝更加容易,并引入了对大型3D图像的改进支持。

  • 自动抓拍允许自动“抓拍”到最近的灯丝,即使当鼠标指针不在中心。
  • 如果路径选择不正确,“向后”绘图将会删除部分被跟踪的灯丝。
  • Autopan将使沿着初始视图外的细丝连续绘图成为可能。
  • 示踪过程中自动计算灯丝直径。
  • 灯丝自动居中。